公司机构设置由总经办（院长办）、技术管理委员会、技管办、办公室、专业所及分公司（分院）组成，其中，办公室下设经营办、行政办、财务办；专业所下设城乡规划所、市政公用所（路桥室、设备室、景观室）、建筑所、交通研究所、风景园林所、建筑装修设计所、咨询研究所、岩土工程所、人防工程所、环保工程所、海绵办；分公司（分院）下设湖南分公司、东莞分公司、深圳分公司、西藏分公司、清远分公司、广州分公司、华南分公司、广西分公司、福州分公司。